Google開(kāi)源可快速?gòu)尼t(yī)療數(shù)字圖片傳輸協(xié)議(Digital Imaging and Communications in Medicine,DICOM)存儲(chǔ)檢索全玻片圖片(Whole Slide Image,WSI)的EZ WSI DICOMWeb函數(shù)庫(kù),以促進(jìn)數(shù)字病理學(xué)應(yīng)用的發(fā)展。
WSI是一項(xiàng)將傳統(tǒng)病理學(xué)切片數(shù)字化的技術(shù),而病理切片則是將組織樣本切成非常薄的薄片,進(jìn)行染色后在顯微鏡下觀察,這是醫(yī)學(xué)診斷的一部分,供醫(yī)療人員觀察癌癥和各種病理狀態(tài)。將病理切片數(shù)字化,就能夠存儲(chǔ)在數(shù)字設(shè)備并在計(jì)算機(jī)上查看,更方便地用于共享、遠(yuǎn)程診斷、教育和研究等目的,同時(shí)還能作為人工智能和機(jī)器學(xué)習(xí)的數(shù)據(jù)源。
但是WSI同時(shí)也存在資料管理挑戰(zhàn),因?yàn)楦叻直媛蕡D像容量非常龐大,要從DICOM存儲(chǔ)中,以DICOMweb檢索特定WSI區(qū)塊(Patch)并不是一件簡(jiǎn)單的事,除了過(guò)程相當(dāng)復(fù)雜,還需要擁有對(duì)DICOM格式的專(zhuān)業(yè)知識(shí)。DICOMweb是DICOM的網(wǎng)頁(yè)標(biāo)準(zhǔn),用于訪問(wèn)、檢索和管理醫(yī)學(xué)圖像資料。
因此Google開(kāi)發(fā)EZ WSI DICOMWeb Python函數(shù)庫(kù)的目的,便是要簡(jiǎn)化這些操作,高效且簡(jiǎn)單地訪問(wèn)WSI區(qū)塊圖像,進(jìn)一步使WSI方便共享和訪問(wèn),促進(jìn)協(xié)作和知識(shí)傳遞,同時(shí)讓研究人員更簡(jiǎn)單地將這些資料用于機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù),在醫(yī)療保健領(lǐng)域推動(dòng)人工智能應(yīng)用。
相較傳統(tǒng)方法,需要從DICOM存儲(chǔ)下載完整的WSI,在本地端截取區(qū)塊圖像,如此不只增加網(wǎng)絡(luò)流量使用,也會(huì)產(chǎn)生更多延遲,并占用大量存儲(chǔ)空間,EZ WSI DICOMWeb函數(shù)庫(kù)直接通過(guò)DICOMweb API檢索需要的WSI區(qū)塊圖像,可以直覺(jué)且簡(jiǎn)潔的使用圖像資料,開(kāi)發(fā)人員也不需要深入了解DICOM的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和API,而能更專(zhuān)注于應(yīng)用開(kāi)發(fā)上。
使用EZ WSI DICOMWeb函數(shù)庫(kù),開(kāi)發(fā)者可以操作云計(jì)算DICOM存儲(chǔ)中的WSI,簡(jiǎn)單截取特定區(qū)塊圖像,加速各種病理學(xué)工作流程,Google現(xiàn)在通過(guò)開(kāi)源此函數(shù)庫(kù),來(lái)加速數(shù)字病理學(xué)的人工智能應(yīng)用發(fā)展。